目前，我国农业科研评价体系存在着“重高产地区、轻低产地区”，“重高产纪录、轻实用性”的弊端。应以中低产田为突破口，进一步完善农业科研评价体系，提高农业科技投入产出效率。
一是瞄准中低产田，优化农业科研投入配置。确定粮食增产潜力较大的中低产地区和作物种类，制定农业科研指南、设定招标课题、分配公共科研资金，鼓励、引导地方和社会科研资金的投入。制定长期规划、分步实施，鼓励符合政策目标的商业性科研加大投入。
二是科学性和应用性并重，进一步完善农业科研评价体系。对教学科研机构及科研人员的评估标准，应以科学性和应用性并重，尤其是粮食作物的科技进步，应更加注重保障粮食安全的现实需要。应加强考核科研成果中的实际增产效果，而非简单考核发表文章和获奖成果。
三是制定提高中低产田农业科技投入产出效率的配套措施。在增加科技投入、完善科技体制的同时，必须把科技投入和基础设施投入有机结合起来。