为推进创新型国家与北京世界城市建设，2010年8月，科技部、农业部、北京市共同启动建设北京农科城。北京农科城以现代服务业引领现代农业，以“高端、高效、高辐射”为目标，实现高端服务、总部经济研发、产业链创业和先导示范功能，促进一二三产业融合发展，为全国现代农业发展提供技术引领和服务支撑。

在科技部和北京市委市政府的领导下，部市联动、统筹资源，创新机制、服务引领，聚焦高端、辐射全国，北京农科城作为国家农业科技协同创新体系的重要组成部分被列入《国家“十二五”科学和技术发展规划》、《“十二五”时期科技北京发展建设规划》。

近三年来，北京农科城建设主要从以下三个方面开展创新实践：一是创新机制体制，构筑农业科技协同创新平台。在农科城领导小组的领导下，抓好顶层设计，开展战略策划，统筹推进农科城建设，并发挥“一城两区”协同创新的龙头带动作用，有力地推进了现代农业创新发展。二是实施创新驱动，服务都市现代农业高端发展。依托“五中心”高端服务平台，服务农业科技创新创业，突破了一批关键技术，推动了北京现代农业产业的快速发展。三是着力现代服务引领，促进一二三产业融合发展。推动特色园区建设，促进产业集群发展，加速创新成果转化应用，促进科技成果惠及民生。

在建设过程中，北京农科城取得了一批重大科技成果。创制了世界首个水稻全基因组芯片，测序世界首张西瓜全基因组图谱，“京萌36号”打破了国外长期垄断我国西葫芦高端品种的格局，北京品牌的高产优质玉米新品种向全国推广约7500万亩，占全国市场的18%，京红、京粉系列作为全国最大的自主创新蛋种鸡品种，占全国市场的50%，种鸡规模亚洲第一。通过持续科技创新推动，抢占农业科技创新高地，促进了首都现代农业快速发展，北京农业科技贡献率已达到69%，高出全国平均水平16个百分点，接近发达国家水平，北京农业技术合同成交额累计148.9亿元，是“十一五”时期农业技术合同成交总额的近2 倍，北京现代农业已步入创新驱动发展的快车道。