1、病 毒 病
   在西葫芦整个生育期均可发病，主要危害叶片和果实。叶片受害后呈系统花叶或系统斑驳，重病株上部叶片呈鸡爪状，上具深绿色疱斑。果实受害导致畸形果，果面具瘤状突起而凹凸不平。病株矮小，结果少，甚至不结果。防治：如提倡利用保护地栽培，提早播种或定植，可有效地防止病毒病的危害；彻底铲除田间地头杂草，避开越冬蔬菜，及时防治蚜虫，防止蚜虫传毒；苗期喷施83增抗剂100倍液，提高幼苗对病毒的抗性；发病初期喷施20%的病毒A可湿性粉剂500倍液或1.5%的植病灵乳剂1000倍液，隔10天左右1次，连续防治2-3次，有一定效果。
2、灰 霉 病
   主要危害西葫芦的花和幼果，严重时危害叶、茎和较大的果实。该病多是由残花先发病，进而使果实脐部腐烂，表面密生灰色霉层。叶片发病多以落上残花的为发病中心，病斑不断扩展，形成大型近圆褐色病斑，表面附着灰褐色霉层。茎和叶柄染病后，易腐烂、折断。病菌喜高湿和低温条件，温度在18-23℃，相对湿度在90%以上，弱光，适宜发病。防治：
第一，控制保护地内温度，可采用滴灌栽培或高畦地膜覆盖暗灌方式；加强通风透光排湿，及时清洁棚面尘土，增强光照强度；合理密植，防止徒长，适时摘除下部老叶、病残叶及花和果实；不要大水漫灌，切忌阴天灌水，防止湿度过大。
    第二，发病后及时摘除病花、病果、病叶，采收结束后彻底清除病残体并带出棚外深埋或烧掉。重病地块，在盛夏农闲时可深翻灌水。
    第三，发病初期可采用烟雾法或粉尘法防治。烟雾法用10%速克灵烟剂，每亩每次用药200-250克，或45%百菌清烟尘剂，每亩每次250克，熏3-4小时。粉尘法于傍晚喷撒10%灭克粉尘剂，或5%百菌清粉尘剂，或10%杀霉灵粉尘剂，每亩每次1千克，隔8-10天1次，连续2-3次。
    第四，发病时可喷布50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液，50%速克灵可湿性粉剂2000倍液，50%扑海因可湿性粉剂1500倍液，65%抗霉威可湿性粉剂1000-1500倍液，50%农利灵可湿性粉剂1000倍液。若几种药剂交替使用效果更佳。
3、畸 形 瓜（果实小，呈尖嘴状）
    畸形的主要原因：1、植株生长发育不良；2、座果过多，造成营养缺乏；3不能正常授粉受精；4、激素施用浓度过高或过低；5、温度高湿度小或温度低湿度高也易出现畸形瓜。
    增施农家肥，促使植株生长健壮；适当座果，并及时采摘；保护地栽培应进行人工授粉，使用激素时应准确掌握浓度和使用时期。
4、蚜虫、白粉虱的药剂防治
    防蚜虫可用20%速灭杀丁（杀灭菊酯）2000-3000倍液，40%菊杀乳油4000倍液喷布，2.5%溴氰菊酯乳油2000-3000倍液，21%灭杀毙乳油4000倍液喷洒。目前，在保护地内用北京产杀瓜蚜1号烟剂，每亩0.5千克，熏蒸一夜，早晨通风，防效达98%以上，效果最佳。
白粉虱以若虫危害植株叶片，多集中在叶背面吸取汁液，造成叶片褪色、变黄、萎蔫。防治白粉虱可选用25%扑虱灵可湿性粉剂1500倍液，25%灭螨猛可湿性粉剂1000倍液，2.5%功夫菊酯乳油2000-3000倍液，2.5%溴氰菊酯乳油2000-3000倍液，2.5%灭王星乳油2000-3000倍液，20%速灭丁乳油2000-3000倍液，均匀喷洒于叶背面。