西瓜整枝要及时，并且分次进行，一般在主蔓长约50cm，侧蔓约15cm时开始整枝，每隔3-5天整枝一次，果实坐住后不再整枝。整枝方式有单蔓整枝，双蔓整枝，三蔓整枝。单蔓整枝是只保留一条主蔓，此方式适于早熟密植栽培，但坐果率小；双蔓整枝是除保留主蔓外，在主蔓基部选留一个健壮侧蔓，其余侧蔓及早摘除。当株距较小、行距较大时，主、侧蔓可以向相反的方向生长，否则以双蔓同向生长为宜。此方式管理简便，适于密植，坐果率高，在早熟栽培或土壤比较瘠薄的地块应重点采用；三蔓整枝是除保留主蔓外，在主蔓基部选留两个健壮，生长势基本相同的侧蔓，其它的侧蔓予以摘除，三蔓整枝坐果率高，易获得高产。也是应用最广泛的一种方式。